实验室PI
自然科学博士(Dr.rer.nat)
邮箱:jingtaolilue@ojlab.ac.cn
2003年毕业于天津大学(材料学/电子信息学双学士学位),2006年获得天津大学药物化学硕士学位。2007年起获全额奖学金赴德国科隆大学攻读博士学位,导师为英国皇家科学院院士,Jonathan Howard教授。毕业后就职于德国马克思-普朗克研究所(MPI),英国剑桥桑格研究所(Wellcome Sanger Institute),欧洲分子生物实验室-生物信息中心(EMBL-EBI)等国际一流科研机构。2019年受葡萄牙Gulbenkian研究所邀请,担任生物信息中心主任,负责里斯本地区多家研究所与医院数据分析工作。2023年8月加入瓯江实验室。
生物信息学,免疫遗传学,第三代基因组测序组装算法与应用
曾负责Sanger小家鼠基因组工程,及国际脊椎动物基因组工程中所有啮齿动物物种的全基因组测序工作。主持包括ERC,FCT等多项国际科研项目。
J Lilue et.al, PLoS genetics 15 (2019), e1008446
J Lilue et.al, Nature genetics 50 (2018), 1574-1583
Y Nakaya, J Lilue et.al, MBio 8 (2017), 10.1128/mbio. 00944-17
J Lilue et.al, eLife 2 (2013), e01298
团队研究方向
基于深度学习的哺乳动物全基因组组装算法,特别是与免疫,行为,感知相关的具有高度多态性的基因位点;小家鼠T2T级别泛基因组的构建与应用;以具有特殊表型的啮齿动物作为蓝本,研究哺乳动物在再生调控以及眼脑健康方面的应用。包括刺毛鼠属的超强神经与器官再生能力;裸鼹鼠的长寿与抗癌表型;沙漠食蝗鼠的抗蝎毒,以及耐受昆虫毒液腐蚀性能;沙漠肥鼠在极度脱水条件下的肾脏保护;欧亚睡鼠在长时间僵睡条件下免疫维持等多个极具科学意义与趣味性的课题。
团队招聘人工智能与生物信息方向助理研究员,博士后与科研助理。
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我们的需求
资深生信专家 / 博士后 / 助理研究员
· 获得计算机(机器学习方向),生物信息学,或遗传学博士
· 具有较强的独立工作能力和良好的团队合作精神
· 良好的英文交流与写作能力
· 熟悉Linux命令行操作系统与基于Slurm的超算作业系统
· 精通以下至少一种编程语言:Python,C++,R,Perl
· 熟悉机器学习与深度学习算法
· 有大规模数据库管理经验,或网页编程与维护经验者优先
生信专家 / 科研助理
· 获得生物学、医学、计算机与信息科学、统计学或相关学科学士及以上学位
· 品行端正,身心健康,责任心强,工作认真负责,善于交流
· 具有以下至少一种专业技能:NGS数据分析,网页构建与维护,数据库管理,R或Python编程,DNA与RNA提取,统计学分析,单细胞测序,Linux系统管理,Linux安装软件维护
· 有一定英文交流能力者优先
应聘材料及联系方式
有意者请将个人简历发送至邮箱jingtaolilue@ojlab.ac.cn,邮件主题注明姓名+应聘岗位。对于博士后等资深岗位,请同时提供未来科研计划与至少一封推荐信。如有问题,欢迎直接邮件联系。
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