Andrei V. Tkatchenko


系统遗传学和药物基因组课题组PI

教授、硕导

原哥伦比亚大学终身教授

邮箱:andreiv.tkatchenko@ojlab.ac.cn




个人简介

特卡琴科教授毕业于俄罗斯国立研究型医科大学,获得医学博士学位和生物化学和分子生物学理学硕士学位。随后,他获得了俄罗斯科学院Engelhardt分子生物学研究所(Engelhardt Institute of Molecular Biology of the Russian Academy of Sciences)的分子生物学博士学位。完成学业后,特卡琴科教授在Engelhardt分子生物学研究所担任研究科学家和高级研究科学家,并在俄罗斯科学院基因生物学研究所担任首席研究科学家。他还曾在法国国家医学研究中心(INSERM)担任访问科学家,并在美国哈佛大学担任达纳-马奥尼(Dana-Mahoney)研究员。

在加入瓯江实验室之前,特卡琴科教授曾担任美国纽约哥伦比亚大学眼科遗传学教授和眼科基础科学课程主任。他在国际顶级学术期刊发表SCI论文30余篇,多次受邀参加国际学术会议并发言。他是欧洲视觉和眼研究协会、视觉和眼科研究协会、国际近视研究所以及其他几个国际科学组织的成员。他曾担任欧洲、澳大利亚和亚洲多个国际研究基金审查委员会的审稿人,并担任多个国际期刊的审稿人或编辑。他曾做过十多次荣誉讲座。

特卡琴科教授是第一个将大规模基因表达谱应用于近视研究的人,也是第一个证明近视的发展与基因表达的大规模变化有关的人。他还发现,灵长类动物出生后的周围视网膜含有增殖的神经元祖细胞,在近视的眼睛中数量增加。特卡琴科教授领导了第一个基因(APLP2)的发现,该基因负责屈光眼发育中基因与环境的相互作用,并导致儿童近视。最近,他的团队已经确定了调节屈光眼发育的主要视网膜通路,并确定了视觉引导的眼睛生长是通过定义明确的视网膜遗传网络由光学离焦调节的。有关这些网络的信息被用于开发抗近视药物开发的药物基因组学管道,该管道已经产生了几种有希望的候选药物,哥伦比亚大学为此发表了三次新闻稿和六项专利。


研究方向

特卡琴科团队的研究围绕屈光眼发育中的基因-环境相互作用,视觉引导眼睛发育的信号通路特征,以及使用系统遗传学和药物基因组学方法开发抗近视药物。



参与项目

特卡琴科教授曾担任多个项目的项目负责人,致力于研究屈光眼发育和近视的基因调控网络,并最终引导了一个重点是鉴定导致人类斯特格氏病(Stargardt disease)和锥杆营养不良的ABCA4基因的修饰基因的项目研究。这些项目多年来得到美国国立卫生研究院、抗盲基金会、防盲研究和许多私人赠款的资助。


代表论著

1. Zeitz C, Roger JE, Audo I, Michiels C, Sánchez-Farías N, Varin J, Frederiksen H, Wilmet B, Callebert J, Gimenez ML, Bouzidi N, Blond F, Guilllonneau X, Fouquet S, Léveillard T, Smirnov V, Vincent A, Héon E, Sahel JA, Kloeckener-Gruissem B, Sennlaub F, Morgans CW, Duvoisin RM, Tkatchenko AV, Picaud S*. Shedding light on myopia by studying complete congenital stationary night blindness. Prog Retin Eye Res. 2023;101155.

2. Tkatchenko TV, Michurina TV, Tomarev SI, Nakaya N, Enikolopov GN, Tkatchenko AV. Critical period for vision-dependent modulation of postnatal retinal neurogenesis. BioRxiv. 2021; DOI: https://doi.org/10.1101/2021.08.30.458213

3. Summers JA, Schaeffel F, Marcos S, Wu H, Tkatchenko AV. Functional integration of eye tissues and refractive eye development: mechanisms and pathways. Exp Eye Res. 2021; 108693.

4. Tkatchenko TV, Tkatchenko AV. Genetic network regulating visual acuity makes limited contribution to visually guided eye emmetropization. Genomics. 2021; 113(4): 2780-2792.

5. Tkatchenko TV, Tkatchenko AV. Genome-wide analysis of retinal transcriptome reveals common genetic network underlying perception of contrast and optical defocus detection. BMC Med Genomics. 2021, 14(1): 153.

6. Tkatchenko TV, Tkatchenko AV. Pharmacogenomic approach to antimyopia drug development: pathways lead the way. Trends Pharmacol Sci. 2019; 40(11): 834-853.

7. Tkatchenko TV, Shah RL, Nagasaki T, Tkatchenko AV. Analysis of genetic networks regulating refractive eye development in collaborative cross progenitor strain mice reveals new genes and pathways underlying human myopia. BMC Med Genomics. 2019; 12(1):113.

8. Tkatchenko TV, Troilo D, Benavente-Perez A, Tkatchenko AV. Gene expression in response to optical defocus of opposite signs reveals bidirectional mechanism of visually guided eye growth. PLoS Biol. 2018; 16(10):e2006021.

9. Tkatchenko AV, Tkatchenko TV, Guggenheim JA, Verhoeven VJ, Hysi PG, Wojciechowski R, Singh PK, Kumar A, Thinakaran G; Consortium for Refractive Error and Myopia (CREAM), Williams C. APLP2 regulates refractive error and myopia development in mice and humans. PLOS Genetics 2015; 11(8): e1005432. 

10. Tkatchenko AV, Walsh PA, Tkatchenko TV, Gustincich S, Raviola E. Form deprivation modulates retinal neurogenesis in primate experimental myopia. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2006; 103: 4681 – 4686.

11. Tkatchenko AV, Visconti RP, Shang L, Papenbrock T, Pruett ND, Ito T, Ogawa M, Awgulewitsch A. Overexpression of Hoxc13 in differentiating keratinocytes results in downregulation of a novel hair keratin gene cluster and alopecia. Development 2001; 128: 1547 – 1558.

个人荣誉

2022

人才奖,浙江省海外人才奖,一等奖

2021-至今

科学研究荣誉学会Sigma Xi正式成员

2021

主题演讲,“屈光眼发育和近视中的MicroRNA-mRNA遗传网络”,欧洲视觉与眼睛研究协会,法国

2019-至今

国际近视学会近视眼与近视实验模型委员会委员

2019

Jonas讲座,“抗近视药物开发的药物基因组学管道:治疗近视的新途径”,哥伦比亚大学,纽约

2002

Dana-Mahoney研究员,哈佛神经科学研究所,哈佛大学,波士顿,马萨诸塞州

2001

Dana-Mahoney研究员,哈佛神经科学研究所,哈佛大学,波士顿,马萨诸塞州

1996–1998

法国国家卫生和医学研究所(INSERM)绿色研究员

1991

杰出成就奖,科研杰出成就奖,俄罗斯科学院恩格尔哈特分子生物学研究所,莫斯科,俄罗斯

1990

杰出成就奖,科研杰出成就奖,俄罗斯科学院恩格尔哈特分子生物学研究所,莫斯科,俄罗斯

1990

创新奖,人类基因组计划基因工程新方法的发展,俄罗斯科学院恩格尔哈特分子生物学研究所,俄罗斯

1989

苏联排名70名博士生,牛津大学举办的竞赛

1988

苏联科学院博士奖学金,苏联


团队介绍

团队领头人Andrei V Tkatchenko

团队成员:Tatiana V Tkatchenko、陈婵婵、匡巧玲、李久泽、王其琛

该团队目前正在开展几个项目,包括屈光眼发育和近视的基因调控网络研究,屈光眼发育和近视的microRNA调控,近视和其他眼病的药物基因组学,药物化学和药物开发。


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招聘需求

团队现招聘分子生物学、分子遗传学、计算机科学、生物信息学、药物化学等领域的优秀人才,包括高级科研人员(组长)、博士后科研人员和研究生。联系方式:chenchanchan@ojlab.ac.cn 。

招聘岗位要求:

  • 博士后研究员 - 分子生物学/遗传学:

拥有分子生物学或分子遗传学博士学位,在顶尖大学有至少3年的博士后经历,并有良好的文献发表记录。需要在分子生物学技术方面的专业知识,如DNA和RNA分离,PCR,原位杂交,克隆,转基因小鼠技术,小鼠遗传学和全基因组方法(如RNA-seq,全基因组测序,亚硫酸氢盐全基因组测序等)。

  • 计算机科学和生物信息学高级研究员:

拥有计算机科学和/或生物信息学博士学位,在顶尖大学有至少5年的博士后经历或5年的博士后行业经验,有良好的文献发表记录,有独立工作和领导研究生和研究科学家团队的能力。本职位要求具有很强的计算机编程和生物信息学方面的专业知识。具有机器学习和/或人工智能方面的专业知识将优先考虑。


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